Alphousseyni Cissé a étudié à l 'Université de Dakar, à l 'École Pratique des Hautes Études en Sciences Religieuses et à la Sorbonne Nouvelle.
Adjoint à la recherche à l 'IFAN jusqu'en 1982, il enseigne au Département d 'Arabe de l 'Université Cheikh Anta Diop de Dakar où il a obtenu son doctorat d 'État en 2007.