Recherche des gènes de tolérance à la salinité chez M. truncatula

Identification in silico via les bases de données biologiques de la protéine kinase de type récepteur riche en cystéine

Le présent manuscrite à pour objectif d’initier la recherche in silico des gènes et des protéines en relation avec la salinité (salt stress) chez l’espèce diploïde qui est la légumineuse modèle Medicago truncatula d’intérêt agronomique important, en utilisant les bases de données biologiques disponibles sur le web (NCBI et EMBL EBI).

Les deux banques de données, ont générés des résultats intéressants et différents en quantité et nature d’information obtenues, avec plus de résultats générés par GenBank (NCBI) par rapport à la base de donné (EMBL- EBI).

La recherche de similitude de séquence chez l'espèce modèle Medicago truncatula en utilisant l’outil BLAST (Basic Local Alignment and Search Tool) a montré des similitudes de séquences significatives pour les protéines kinases (protéine kinase de type récepteur riche en cystéine) par rapport à l’espèce tétraploïde Medicago sativa, ce qui ouvre une perspective de recherche encore plus approfondie en utilisant d’autres bases de données spécialisées afin d’avoir des informations suffisantes et exploitables sur l’expression des gènes.