Prédiction de l'interaction entre génotype et environnement au Sahel
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Prédiction de l'interaction entre génotype et environnement au Sahel

IBNOU DIENG

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Prédiction de l'interaction Génotype x Environnement par linéarisation et régression PLS-mixte

Ce travail porte sur la prédiction de l'interaction entre génotype et environnement (GxE) et est appliquée au contexte sahélien.

Après un tour d'horizon des principales méthodes d'analyse de la littérature, nous proposons la méthode APLAT.

Le rendement de génotypes prédit à l'aide de covariables d'environnement par un modèle de simulation de cultures est développée en série de Taylor à l'ordre 1 au voisinage du vecteur de paramètres d'un génotype de référence.

Nous nous ramenons alors approximativement à un modèle linéaire où la matrice des regresseurs est remplacée par celle des dérivées partielles par rapport aux paramètres.

Le très grand nombre de paramètres variétaux généralement constatée dans les modèles de simulation de cultures conduit à un nombre important de regresseurs; d'où une estimation par régression Partial Least Squares (PLS).

Par la suite, nous proposons APLAT-mixte, une extension de APLAT et introduisons la technique PLS-Mixte pour estimer les composantes de variance dans un modèle où il y a plus de regresseurs que d'observations.

L'algorithme itératif proposée consiste à imbriquer la régression PLS dans l'algorithme Expectation Maximization (EM).

Format : Papier

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Quantité
Disponible

L''auteur travaille au Centre du Riz pour l''Afrique (AfricaRice), l''un des 15 centres du Groupe consultatif pour la recherche agricole internationale (GCRAI) au Bénin.

Avant cela, il a travaillé au Centre d''étude régional pour l''amélioration de l''adaptation a la sécheresse (Ceraas) au Sénégal et au Centre régional AGRHYMET-CILSS au Niger.


Fiche technique

Auteur
IBNOU DIENG
Langue
Français
Éditeur
Éditions universitaires européennes
Année
2010
Pays
Bénin Bénin

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